Moser zog 1989 für die FPÖ in den Nationalrat ein und unterstützte 1993 die Gründung des liberalen Forum. Er blieb bis 1999 Nationalratsabgeordneter.
Danach setzte Moser seine Offiziers-Karriere beim österreichischen Bundesheer fort, war Verteidigungsattaché in verschiedenen europäischen Städten und zuletzt Leiter der Kontrollabteilung A in der Generalstabsdirektion des Bundesheers. 2005 geriet er in den Verdacht, in Waffengeschäfte in Ruanda verwickelt zu sein und damit gegen das Neutralitäts- und Kriegsmaterialiengesetz zu verstoßen.